Матрицы сайтов связывания транскрипционных факторов (ArtSite)

Тип разработки: 
База данных
Регистрационный номер в ФАП: 
DB10007
Дата регистрации в ФАП: 
2010-04-19
Тематическая направленность: 
молекулярная биология, биоинформатика
Разработчики программы (базы данных): 
Аннотация: 

База данных ArtSite предназначена для аннотации экспериментальной информации по структуре сайтов связывания транскрипционных факторов (ТФ) у про- и эукариот. База основана на описании структуры сайтов связывания ТФ с помощью частотных матриц, которые построены в результате выравнивания представительных выборок нуклеотидных последовательностей сайтов связывания ТФ. Выборки сайтов созданы на основе in vitro синтезированных последовательностей, выявленных с помощью различных методов селекции, и описанных в научных статьях, опубликованных в открытой печати. База представляет интерес для всех исследователей, занимающихся изучением механизмов регуляции экспрессии генов как у про-, так и у эукариот и может быть использована для распознавания сайтов связывания ТФ при исследовании геномов различных видов организмов.
Язык программирования: Icarus
СУБД: Sequence Retrieval System (SRS)

Использованные при разработке материалы: 
не использовались
Регистрационный номер в Роспатенте: 
№2006620167
Признак доступности программы (базы данных): 
доступ по запросу
Требования к аппаратным и программным средствам: 

Тип реализующей ЭВМ: IBM PC Pentium – Pentium IV, архитектура i386
Операционная система: UNIX, Linux;
формат: text MS-DOS, flat file

Контактная информация: 
tamara@bionet.nsc.ru