База данных ассоциативных сетей (ЭНДЦелл)/Associative network database (ANDCell)

Тип разработки: 
База данных
Регистрационный номер в ФАП: 
DB10005
Дата регистрации в ФАП: 
2010-04-19
Тематическая направленность: 
Биоинформатика
Аннотация: 

База данных ассоциативных сетей (ЭНДЦелл)/Associative network database (ANDCell) предназначена для реконструкции ассоциативных сетей, описывающих молекулярно-генетические взаимодействия в клетке, а также ассоциативные связи генов с заболеваниями. База данных может быть использована в области молекулярной биологии, медицины и биотехнологии, а также других областях, связанных с изучением молекулярно-генетических систем.
База данных содержит информацию, автоматически извлеченную из текстов рефератов базы данных Pubmed методами Text-Mining, о молекулярно-биологических взаимодействиях между генами, белками, микроРНК, метаболитами, молекулярные процессами, клеточными компонентами. В базе данных представлены взаимодействия следующих типов:
1)физические взаимодействия между белками, белками и низкомолекулярными соединениями, белками и генами;
2)ассоциативные связи между белками, генами, низкомолекулярными соединениями и заболеваниями;
3)каталитические реакции;
4)регуляция:
стабильности белка, посредством пострансляционных модификаций;
активности белка, посредством пострансляционных модификаций;
экспрессии гена;
клеточных процессов.

Использованные при разработке материалы: 
Не использованы
Регистрационный номер в Роспатенте: 
2008620439
Признак доступности программы (базы данных): 
доступ по запросу
Требования к аппаратным и программным средствам: 

Тип реализующей ЭВМ: IBM PC Pentium – Pentium IV, архитектура i386
Язык программирования: СУБД MySQL 5.0
Операционная система: тип WIDOWS, UNIX
Объем кода: 17306 Мбайт

Контактная информация: 
salix@bionet.nsc.ru