Программа распознавания функциональных сайтов в пространственных структурах белков (ПДБСайтСкан)/Program for search of functional sites in the spatial structures of proteins (PDBSiteScan)

Тип разработки: 
Программа
Регистрационный номер в ФАП: 
PR10017
Дата регистрации в ФАП: 
2010-04-21
Тематическая направленность: 
Биоинформатика
Разработчики программы (базы данных): 
Аннотация: 

Программа распознавания функциональных сайтов в пространственных структурах белков (ПДБСАЙТСКАН)/Program for search of functional sites in the spatial structures of proteins (PDBSiteScan) предназначена для функциональной аннотации белковых молекул, реконструкции сетей белок-белковых и белок-лиганд взаимодействий. Программа может быть использована в области молекулярной биологии, медицины и биотехнологии, а также других областях, связанных с изучением функционального строения белков и молекулярно-генетических систем. Программа позволяет распознавать функциональные сайты в пространственных структурах белков, включая: сайты каталитических центров ферментов, сайты пострансляционных модификаций белков, сайты связывания ионов металлов, сайты связывания органических и неорганических лигандов, сайты связывания ДНК и РНК. Программа обеспечивает выявление функционально важных свойств структуры белков, необходимых для решения задач идентификации функции белков, поиска мишеней для лекарственных препаратов и целенаправленного конструирования белков с улучшенными медико-биологическими свойствами.

Использованные при разработке материалы: 
База данных PDBSite
Регистрационный номер в Роспатенте: 
2006610271
Признак доступности программы (базы данных): 
полностью свободный доступ
Требования к аппаратным и программным средствам: 

Тип реализующей ЭВМ: IBM PC Pentium – Pentium IV, AMD Platform 64
Язык программирования: C
Операционная система: тип WIDOWS, UNIX
Объем кода: 134 Мбайт

Контактная информация: 
salix@bionet.nsc.ru