Регуляторные районы генов прокариот (ProkaTEX)

Тип разработки: 
База данных
Регистрационный номер в ФАП: 
DB10012
Дата регистрации в ФАП: 
2010-04-19
Тематическая направленность: 
молекулярная биология, биоинформатика
Аннотация: 

База данных ProkaTEX предназначена для накопления экспериментальных данных по структуре регуляторных районов генов у различных видов бактерий, а также данных по экспрессии генов в зависимости от стадии роста бактериальной культуры, источников питания и дыхания, различных внешних воздействий и т.д.
Комплексное описание регуляции транскрипции генов прокариот, представленное в базе ProkaTEX, является основой для решения большого числа актуальных задач биоинформатики и представляет интерес для исследователей, занимающихся анализом закономерностей структурно-функциональной организации районов регуляции транскрипции генов прокариот; распознаванием сайтов связывания транскрипционных факторов; изучением механизмов транскрипции; реконструкцией генных сетей; моделированием молекулярно-генетических процессов в бактериальной клетке; интерпретацией данных microarray и т.д.
Источником информации для базы является аннотация научных статей, опубликованных в открытой печати.
Язык программирования: Icarus
СУБД: Sequence Retrieval System (SRS)

Использованные при разработке материалы: 
не использовались
Регистрационный номер в Роспатенте: 
№2006620257
Признак доступности программы (базы данных): 
доступ по запросу
Требования к аппаратным и программным средствам: 

Тип реализующей ЭВМ: IBM PC Pentium – Pentium IV, архитектура i386
Операционная система: UNIX, Linux
text MS-DOS, flat-file

Контактная информация: 
tamara@bionet.nsc.ru; kol@bionet.nsc.ru