Разработки СО РАН - каталоги программ и БД

Назначение:
Моделирование функционирования локальной вычислительной сети, атак типа SYN FLOOD и методов защиты 

Область применения:
Исследование DDoS атак типа "SYN FLOOD" с различными алгоритмами проведения, топологиями сетей и масшатабами атак. А также методов защиты от них.

Используемый алгоритм:
Для разработки использовался мультиагентный подход, позволящий описывать поведение отдельных частей модели, без полного описания функционирования всей системы. Для программы были созданы модели функционирования типовых пользовательских ЭВМ, WEB серверов по раздаче HTTP контента, атакующих узлов и средств защиты. Описывая правила взаимодействия между частями модели, мультиагентный подход позволяет создавать самоорганизующиеся системы. Таким образом, запуская группы агентов в модель, можно наблюдать различные алгоритмы протекания атаки "SYN FLOOD" (http://www.cert.org/advisories/CA-1996-21.html) и эффективность средст защиты (Шахов В.В., Родионов А.С. Анализ средств противодействия одному виду атак типа “отказ в обслуживании” // Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, том 6, вып. 2. – С. 80-88.)

Функциональные возможности:
На входе в программу подается конфигурационный файл модели: количество агентов каждого типа и их входные характеристики, на выходе -  данные о трафике, циркулирующем внутри модели. При запуске создаются агенты, имитирующие поведение пользовательских компьютеров, HTTP серверов и атакующих средств. Сначала агенты выстраивают топологию локальной вычислительной сети, а затем моделируют её работу. Есть специальный агент, инициирующий SYN FLOOD атаку. Он выбирает "жертву" - HTTP сервер, и активирует все компьютеры-"зомби" , указывая им цель. Далее моделируется поведение сети с происходящей в ней атакой типа SYN Flood.

Инструментальные средства создания
Модель создана на основе платформы мультиагентного программирования JADE, написана на языке программирования JAVA.
Модель - это набор  JADE агентов, и для ее функционирования необходима сама платформа JADE.

Разработано при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (код проекта 11-07-00183)

База данных "Интерферон-индуцируемые гены" содержит информацию об организации регуляторных районов и особенностях экспрессии генов эукариот, транскрипция которых усиливается под действием интерферонов I и II типа.
В базе данных собрана экспериментальная информация о механизмах активации генов и о транскрипционных факторах, участвующих в процессе активации, особенностях экспрессии генов в зависимости от типа клеток, ткани, влияния индукторов и т.д. Имеется информация о протяженных регуляторных районах (промоторах, энхансерах, сайленсерах), стартах транскрипции, сайтах связывания транскрипционных факторов, белках, влияющих на уровень транскрипции гена и т.д.
Назначение - изучение молекулярных механизмов активации интерфероновой системы.
Область применения - информационная биология, молекулярная генетика, медицина, фармакология.

База данных доступна по адресу:
http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/papers/ananko/iig-trrd/
 

Назначение - программа для распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов
Область применения - биология и медицина
Используемый алгоритм -  разработка автора, алгоритм SITECON.
Алгоритм опубликован в статье Oshchepkov D.Y., Vityaev E.E., Grigorovich D.A., Ignatieva E.V., Khlebodarova T.M. SITECON: a tool for detecting conservative conformational and physicochemical properties in transcription factor binding site alignments and for site recognition. Nucleic Acids Res. 2004 Jul 1;32(Web Server issue):W208-12.
Функциональные возможности - выявление консервативных конформационных и физико-химических свойств для выборок сайтов связывания транскрипционных факторов; распознавание новых потенциальных сайтов связывания транскрипционных факторов на основе сравнения значения выявленных консервативных свойств со свойствами анализируемой последовательности.
Инструментальные средства создания - С++

Интернет версия доступна по адресу http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/programs/sitecon/