Разработки СО РАН - каталоги программ и БД

Поиск по каталогам:

2010-04-19

Назначение - оптимизация структуры белок-лигандных комплексов. Область применения - молекулярная биология, химия. Используемый алгоритм - LBFGS для оптимизации геометрии. Функциональные возможности - работает в составе комплекса BAUBLE + EMINIMA + MONTEDOCK. Инструментальные средства создания - С++. Основывается на коде, опубликованном в "A library of software components for molecular modeling programs" авторов E.S. Fomin, N.A. Alemasov, A.S. Chirtsov and A.E. Fomin. Biophysics. 51, suppl. 1 (2006) 110-112.

2010-04-16

Программный комплекс SMILE (Statistical Modeling In Low-desity Environment) предназначен для проведения численного моделирования течений газа в широком диапазоне чисел Кнудсена методом прямого статистического моделирования Монте-Карло.
Основные особенности: Моделирование двумерных, осесимметричных и трёхмерных течений; Учёт реальных свойств газа; Широкая база данных по свойствам газов; Возможность работы как на однопроцессороном компьютере, так и удалённо на многопроцессорных кластерах; Развитый графический пользовательский интерфейс.

Программный комплекс SMILE может быть использован для широкого круга задач динамики разреженного газа: от проведения расчётов спуска космических аппаратов с орбиты до моделирования течения в микроканалах.

2010-04-16

Программная система RuSat (Rapid Unified Satellite Aerodymanics Toolkit) предназначена для расчётов аэродинамики тел в гиперзвуковом потоке инженерными методами. Основная область применения -- проведение большого количества многопараметрических расчётов на начальном этапе проектирования аэродинамической формы космических аппаратов. С помощью RuSat можно быстро оценить аэродинамические нагрузки на космический аппарат при большом количестве вариантов начальных данных (углов атаки и скольжения, высоты, отклонения органов управления и т.п.). Программа имеет клиент-серверную архитектуру. Посчитанные варианты хранятся в централизованной базе данных на сервере, благодаря чему доступ к ним может быть осуществлён с любой машины в сети.

2010-04-16

Функциональные возможности базы данных:  База данных “Генные сети Арабидопсиса (ГСА)” содержит информацию о генах, регулирующих морфогенез, их экспрессии, влиянии мутаций на молекулярный и морфологический фенотип растений. На основе наиболее изученного с генетической точки растения и наиболее секвенированного и аннотированного к настоящему времени генома эукариот, AGNS обеспечивает представление данных по морфогенезу растений в формате, детально описывающем морфогенез от нуклеотидной последовательности до фенотипа, и, в тоже время, позволяющем производить компьютерный логический анализ этих данных.
Назначение - Ресурс по экспериментальным данным о паттернах экспрессии и фенотипическим аномалиям развития арабидопсиса.
Область применения - Генетика развития растения.
Инструментальные средства создания - Java, Berkeley DB XML.

2010-04-16

Функциональные возможности программы
Данная программа позволяет моделировать динамику астрофизических газовых объектов произвольной геометрии. В качестве входных параметров задаётся описание начальной конфигурации газовых объектов (распределение плотности, скорости, давления, форма и т.п.), параметры расчётной сетки, физические постоянные. Выходными данными являются графики поведения различных видов энергий, распределения плотности, скорости и давления газовых объектов.

Назначение
Программа предназначена для проведения вычислительных экспериментов по моделированию динамики астрофизических газовых объектов. Программа предназначена для специалистов в области астрофизики, астрономии и исследования космического пространства для проверки, подтверждения, коррекции и т.п. создаваемых и уже известных астрофизических законов.

Область применения
Астрофизика, астрономия и исследование космического пространства.

Инструментальные средства создания
Язык Фортран-90 (для модулей, предназначенных для решения газодинамических уравнений), С/С++ (для модуля решения уравнения Пуассона), библиотека MPI для задания межпроцессорных коммуникаций, библиотека FFTW для трёхмерного параллельного преобразования Фурье.